Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms