Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mfsd13aQ6PDE8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms