Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAM0

Prkab2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab2Q6PAM0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prkab2Q6PAM0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Prkab2Q6PAM0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prkab2Q6PAM0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prkab2Q6PAM0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prkab2Q6PAM0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prkab2Q6PAM0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Prkab2Q6PAM0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Prkab2Q6PAM0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prkab2Q6PAM0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prkab2Q6PAM0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prkab2Q6PAM0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Prkab2Q6PAM0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prkab2Q6PAM0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms