Protein–RNA interactions for Protein: Q6P6I6

Polr2m, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2mQ6P6I6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr2mQ6P6I6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr2mQ6P6I6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms