Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp12Q6P5B0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms