Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Podnl1Q6P3Y9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Podnl1Q6P3Y9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Podnl1Q6P3Y9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Podnl1Q6P3Y9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Podnl1Q6P3Y9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Podnl1Q6P3Y9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Podnl1Q6P3Y9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Podnl1Q6P3Y9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Podnl1Q6P3Y9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Podnl1Q6P3Y9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Podnl1Q6P3Y9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Podnl1Q6P3Y9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Podnl1Q6P3Y9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Podnl1Q6P3Y9 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Podnl1Q6P3Y9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Podnl1Q6P3Y9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Podnl1Q6P3Y9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Podnl1Q6P3Y9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Podnl1Q6P3Y9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Podnl1Q6P3Y9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Podnl1Q6P3Y9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Podnl1Q6P3Y9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Podnl1Q6P3Y9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Podnl1Q6P3Y9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Podnl1Q6P3Y9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Podnl1Q6P3Y9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Podnl1Q6P3Y9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Podnl1Q6P3Y9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Podnl1Q6P3Y9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Podnl1Q6P3Y9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms