Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E8

Efcab6, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcab6Q6P1E8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Efcab6Q6P1E8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Efcab6Q6P1E8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Efcab6Q6P1E8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Efcab6Q6P1E8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Efcab6Q6P1E8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Efcab6Q6P1E8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Efcab6Q6P1E8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Efcab6Q6P1E8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Efcab6Q6P1E8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Efcab6Q6P1E8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Efcab6Q6P1E8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Efcab6Q6P1E8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Efcab6Q6P1E8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Efcab6Q6P1E8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Efcab6Q6P1E8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Efcab6Q6P1E8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Efcab6Q6P1E8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Efcab6Q6P1E8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Efcab6Q6P1E8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Efcab6Q6P1E8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Efcab6Q6P1E8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Efcab6Q6P1E8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Efcab6Q6P1E8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Efcab6Q6P1E8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Efcab6Q6P1E8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Efcab6Q6P1E8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Efcab6Q6P1E8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Efcab6Q6P1E8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Efcab6Q6P1E8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms