Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slx4Q6P1D7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slx4Q6P1D7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Slx4Q6P1D7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Slx4Q6P1D7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Slx4Q6P1D7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Slx4Q6P1D7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Slx4Q6P1D7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Slx4Q6P1D7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Slx4Q6P1D7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Slx4Q6P1D7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Slx4Q6P1D7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Slx4Q6P1D7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Slx4Q6P1D7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Slx4Q6P1D7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Slx4Q6P1D7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Slx4Q6P1D7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Slx4Q6P1D7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slx4Q6P1D7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slx4Q6P1D7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slx4Q6P1D7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slx4Q6P1D7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slx4Q6P1D7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slx4Q6P1D7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slx4Q6P1D7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slx4Q6P1D7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Slx4Q6P1D7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Slx4Q6P1D7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Slx4Q6P1D7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Slx4Q6P1D7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Slx4Q6P1D7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Slx4Q6P1D7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Slx4Q6P1D7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Slx4Q6P1D7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Slx4Q6P1D7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Slx4Q6P1D7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Slx4Q6P1D7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Slx4Q6P1D7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Slx4Q6P1D7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Slx4Q6P1D7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Slx4Q6P1D7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Slx4Q6P1D7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Slx4Q6P1D7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Slx4Q6P1D7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Slx4Q6P1D7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Slx4Q6P1D7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Slx4Q6P1D7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Slx4Q6P1D7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Slx4Q6P1D7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Slx4Q6P1D7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Slx4Q6P1D7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Slx4Q6P1D7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Slx4Q6P1D7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Slx4Q6P1D7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Slx4Q6P1D7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Slx4Q6P1D7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Slx4Q6P1D7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Slx4Q6P1D7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Slx4Q6P1D7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Slx4Q6P1D7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Slx4Q6P1D7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Slx4Q6P1D7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Slx4Q6P1D7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slx4Q6P1D7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Slx4Q6P1D7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slx4Q6P1D7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slx4Q6P1D7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slx4Q6P1D7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slx4Q6P1D7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slx4Q6P1D7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slx4Q6P1D7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slx4Q6P1D7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slx4Q6P1D7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slx4Q6P1D7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slx4Q6P1D7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slx4Q6P1D7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slx4Q6P1D7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slx4Q6P1D7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slx4Q6P1D7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slx4Q6P1D7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slx4Q6P1D7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slx4Q6P1D7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slx4Q6P1D7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slx4Q6P1D7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slx4Q6P1D7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slx4Q6P1D7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Slx4Q6P1D7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slx4Q6P1D7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slx4Q6P1D7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slx4Q6P1D7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slx4Q6P1D7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slx4Q6P1D7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slx4Q6P1D7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slx4Q6P1D7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slx4Q6P1D7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slx4Q6P1D7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slx4Q6P1D7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slx4Q6P1D7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slx4Q6P1D7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slx4Q6P1D7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms