Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptpdc1Q6NZK8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptpdc1Q6NZK8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms