Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXW6

Rad17, Cell cycle checkpoint protein RAD17, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad17Q6NXW6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rad17Q6NXW6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rad17Q6NXW6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rad17Q6NXW6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rad17Q6NXW6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rad17Q6NXW6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rad17Q6NXW6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rad17Q6NXW6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rad17Q6NXW6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rad17Q6NXW6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rad17Q6NXW6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rad17Q6NXW6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rad17Q6NXW6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rad17Q6NXW6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rad17Q6NXW6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rad17Q6NXW6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rad17Q6NXW6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rad17Q6NXW6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rad17Q6NXW6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rad17Q6NXW6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rad17Q6NXW6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rad17Q6NXW6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rad17Q6NXW6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rad17Q6NXW6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rad17Q6NXW6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rad17Q6NXW6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rad17Q6NXW6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rad17Q6NXW6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rad17Q6NXW6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rad17Q6NXW6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rad17Q6NXW6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rad17Q6NXW6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rad17Q6NXW6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rad17Q6NXW6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rad17Q6NXW6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rad17Q6NXW6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rad17Q6NXW6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rad17Q6NXW6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rad17Q6NXW6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rad17Q6NXW6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rad17Q6NXW6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rad17Q6NXW6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rad17Q6NXW6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rad17Q6NXW6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rad17Q6NXW6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rad17Q6NXW6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms