Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms