Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gpbp1Q6NXH3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms