Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SphkapQ6NSW3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SphkapQ6NSW3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SphkapQ6NSW3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SphkapQ6NSW3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SphkapQ6NSW3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SphkapQ6NSW3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SphkapQ6NSW3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SphkapQ6NSW3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SphkapQ6NSW3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SphkapQ6NSW3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SphkapQ6NSW3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SphkapQ6NSW3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SphkapQ6NSW3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SphkapQ6NSW3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SphkapQ6NSW3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SphkapQ6NSW3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SphkapQ6NSW3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SphkapQ6NSW3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SphkapQ6NSW3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SphkapQ6NSW3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SphkapQ6NSW3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SphkapQ6NSW3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SphkapQ6NSW3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SphkapQ6NSW3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SphkapQ6NSW3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SphkapQ6NSW3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SphkapQ6NSW3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SphkapQ6NSW3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SphkapQ6NSW3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SphkapQ6NSW3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SphkapQ6NSW3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SphkapQ6NSW3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SphkapQ6NSW3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SphkapQ6NSW3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SphkapQ6NSW3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SphkapQ6NSW3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SphkapQ6NSW3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SphkapQ6NSW3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SphkapQ6NSW3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SphkapQ6NSW3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SphkapQ6NSW3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms