Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arhgap20Q6IFT4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms