Protein–RNA interactions for Protein: Q6H1V1

Best3, Bestrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best3Q6H1V1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Best3Q6H1V1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Best3Q6H1V1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Best3Q6H1V1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms