Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV7

Edrf1, Erythroid differentiation-related factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edrf1Q6GQV7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Edrf1Q6GQV7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Edrf1Q6GQV7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms