Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZU6

Thsd7a, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, mousemouse

Predictions only

Length 1,645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7aQ69ZU6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Thsd7aQ69ZU6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Thsd7aQ69ZU6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Thsd7aQ69ZU6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Thsd7aQ69ZU6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Thsd7aQ69ZU6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Thsd7aQ69ZU6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Thsd7aQ69ZU6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Thsd7aQ69ZU6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Thsd7aQ69ZU6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Thsd7aQ69ZU6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Thsd7aQ69ZU6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Thsd7aQ69ZU6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Thsd7aQ69ZU6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Thsd7aQ69ZU6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Thsd7aQ69ZU6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Thsd7aQ69ZU6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms