Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pdzrn3Q69ZS0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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