Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms