Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
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Cntn4Q69Z26 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Cntn4Q69Z26 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Cntn4Q69Z26 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Cntn4Q69Z26 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Cntn4Q69Z26 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Cntn4Q69Z26 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Cntn4Q69Z26 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cntn4Q69Z26 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms