Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG3

Spty2d1, Protein SPT2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spty2d1Q68FG3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Spty2d1Q68FG3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms