Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn2Q68FG2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms