Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab3ipQ68EF0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms