Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc8eQ66JT1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc8eQ66JT1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms