Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usf2Q64705 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usf2Q64705 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms