Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Top2bQ64511 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Top2bQ64511 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Top2bQ64511 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Top2bQ64511 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
Top2bQ64511 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms