Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gja3Q64448 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gja3Q64448 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gja3Q64448 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gja3Q64448 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gja3Q64448 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gja3Q64448 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gja3Q64448 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gja3Q64448 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gja3Q64448 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gja3Q64448 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gja3Q64448 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gja3Q64448 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Gja3Q64448 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gja3Q64448 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gja3Q64448 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gja3Q64448 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gja3Q64448 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gja3Q64448 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gja3Q64448 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gja3Q64448 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gja3Q64448 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gja3Q64448 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gja3Q64448 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gja3Q64448 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gja3Q64448 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gja3Q64448 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gja3Q64448 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Gja3Q64448 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gja3Q64448 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gja3Q64448 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gja3Q64448 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gja3Q64448 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gja3Q64448 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gja3Q64448 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gja3Q64448 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gja3Q64448 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gja3Q64448 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gja3Q64448 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gja3Q64448 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gja3Q64448 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gja3Q64448 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gja3Q64448 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gja3Q64448 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms