Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc18Q640L5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc18Q640L5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccdc18Q640L5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccdc18Q640L5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccdc18Q640L5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccdc18Q640L5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccdc18Q640L5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccdc18Q640L5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccdc18Q640L5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccdc18Q640L5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccdc18Q640L5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccdc18Q640L5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccdc18Q640L5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms