Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col4a5Q63ZW6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col4a5Q63ZW6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col4a5Q63ZW6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms