Protein–RNA interactions for Protein: Q62521

Zic3, Zinc finger protein ZIC 3, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic3Q62521 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic3Q62521 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms