Protein–RNA interactions for Protein: Q62457

Gm20917, (clone BALB8N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20917Q62457 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm20917Q62457 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20917Q62457 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20917Q62457 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20917Q62457 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20917Q62457 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm20917Q62457 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm20917Q62457 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20917Q62457 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20917Q62457 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20917Q62457 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20917Q62457 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm20917Q62457 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20917Q62457 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20917Q62457 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20917Q62457 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20917Q62457 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms