Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ndufa4Q62425 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ndufa4Q62425 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ndufa4Q62425 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ndufa4Q62425 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ndufa4Q62425 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ndufa4Q62425 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ndufa4Q62425 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ndufa4Q62425 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ndufa4Q62425 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ndufa4Q62425 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ndufa4Q62425 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufa4Q62425 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufa4Q62425 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufa4Q62425 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufa4Q62425 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufa4Q62425 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufa4Q62425 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufa4Q62425 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufa4Q62425 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufa4Q62425 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufa4Q62425 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufa4Q62425 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufa4Q62425 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufa4Q62425 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufa4Q62425 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufa4Q62425 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufa4Q62425 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufa4Q62425 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufa4Q62425 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufa4Q62425 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufa4Q62425 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufa4Q62425 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufa4Q62425 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufa4Q62425 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufa4Q62425 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufa4Q62425 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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