Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms