Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TrhQ62361 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TrhQ62361 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TrhQ62361 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TrhQ62361 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TrhQ62361 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TrhQ62361 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TrhQ62361 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TrhQ62361 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TrhQ62361 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TrhQ62361 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms