Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Sall3Q62255 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sall3Q62255 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms