Protein–RNA interactions for Protein: Q62249

Sox19, Protein SOX-19 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox19Q62249 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox19Q62249 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms