Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms