Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssr4Q62186 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssr4Q62186 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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