Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RhocQ62159 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhocQ62159 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RhocQ62159 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RhocQ62159 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RhocQ62159 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RhocQ62159 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RhocQ62159 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RhocQ62159 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RhocQ62159 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RhocQ62159 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RhocQ62159 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RhocQ62159 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RhocQ62159 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RhocQ62159 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RhocQ62159 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RhocQ62159 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RhocQ62159 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RhocQ62159 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RhocQ62159 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RhocQ62159 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RhocQ62159 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RhocQ62159 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RhocQ62159 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RhocQ62159 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RhocQ62159 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RhocQ62159 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RhocQ62159 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RhocQ62159 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RhocQ62159 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RhocQ62159 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RhocQ62159 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RhocQ62159 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RhocQ62159 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms