Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim27Q62158 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim27Q62158 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms