Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd47Q61735 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms