Protein–RNA interactions for Protein: Q61718

Ifna15, Alpha-interferon, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna15Q61718 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ifna15Q61718 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna15Q61718 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms