Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AtrxQ61687 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms