Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccne1Q61457 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms