Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd53Q61451 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd53Q61451 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd53Q61451 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd53Q61451 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd53Q61451 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd53Q61451 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd53Q61451 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd53Q61451 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd53Q61451 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd53Q61451 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd53Q61451 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd53Q61451 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd53Q61451 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd53Q61451 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd53Q61451 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd53Q61451 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd53Q61451 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd53Q61451 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd53Q61451 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms