Protein–RNA interactions for Protein: Q61450

Gp49a, Mast cell surface glycoprotein Gp49A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp49aQ61450 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp49aQ61450 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp49aQ61450 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp49aQ61450 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp49aQ61450 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp49aQ61450 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp49aQ61450 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp49aQ61450 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp49aQ61450 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp49aQ61450 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp49aQ61450 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp49aQ61450 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp49aQ61450 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp49aQ61450 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp49aQ61450 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp49aQ61450 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp49aQ61450 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp49aQ61450 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp49aQ61450 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp49aQ61450 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp49aQ61450 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp49aQ61450 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp49aQ61450 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp49aQ61450 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp49aQ61450 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp49aQ61450 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp49aQ61450 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp49aQ61450 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp49aQ61450 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp49aQ61450 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp49aQ61450 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp49aQ61450 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp49aQ61450 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms