Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna1eQ61290 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms