Protein–RNA interactions for Protein: Q61189

Clns1a, Methylosome subunit pICln, mousemouse

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Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clns1aQ61189 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clns1aQ61189 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clns1aQ61189 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clns1aQ61189 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clns1aQ61189 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clns1aQ61189 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clns1aQ61189 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Clns1aQ61189 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Clns1aQ61189 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Clns1aQ61189 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Clns1aQ61189 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Clns1aQ61189 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Clns1aQ61189 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Clns1aQ61189 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms