Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms