Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc9a1Q61165 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc9a1Q61165 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms